工程预算的审核依据主要包括：
1、 有关工程建设和造价管理的法律、法规和方针政策。
2、施工图设计项目一览表、各专业施工图设计图纸和文字说明、工程地质勘察资料。
3、主管部门颁布的现行预算定额以及工程量清单计价规范。
4、施工组织设计或施工方案。
5、费用计算规则及取费标准。
6、预算工作手册或建材五金手册。
7、地区人工工资、材料及机械台班预算价格若有两次以上结算或签订两份以上合同产生两份以上结算时，在分次结算中要注意之前结算与之后结算的工程量衔接，之前结算一定要用文字或图示标（说）明已结范围和位置，之后结算要在结算前先核对之前各结算书已结时间段、位置和范围，避免重复。要求现场工程师在向成本控制中心报送资料中定要注明每次结算的实际施工位置或距离。
承包工程合同签定不规范，工程结算计价难以确定。工程预算在审计过程中发现，建设、施工双方承包工程合同签订不规范。在签订合同时不按投标文件的内容逐一填写，尤其是建筑规模和中标价，存在少填或者不填的现象，给工程计价取费留下活口，目的是为了竣工后高报工程结算价格打下伏笔，使得原本十分严肃的合同失去约束作用，建设单位失去了对施工单位工程报价的有效监督，容易造成决算价格偏高。同时，给工程结算造价审核带来难度和风险。
工程量清单计量一般是根据每月完成的合同内实物工作量经监理工程师签认合格准予计量的工程细目，它有阶段性、按实计量的特点。根据这个特点，应在过程中来进行控制，而不是依靠事后发现超计量以后再扣回。工程预算计量人员（工地监理组、指挥部或总监办的工程部、计划部）均应认真学习合同文件和招标文件中的计量条款，心中应明确哪些项目可以计量，哪些项目不能计量，属于包含在其他工程项目中的内容（例如：涵洞计量是以延米综合单价计量的，因此其挖基、回填、清淤、基础垫层、出入口铺砌等均不能单独计量。
施工时，由于地质条件（如水下条件的变化、地斟资料不到位或有误等）的变化，常常由于地质条件发生了变化，对工程量有增减的影响，于是导致工程预算也发生增减，因此需要在设计初期对地质条件等方面进行较为全面的考察测定，同时收集完备的资料信息以及相关数据或报告。预算定额水平、间接费用、计划利润率、税率等定额费用标准以及政策性变动等如果发生变化，也会对工程预算有所影响，伊犁工程预算因为这些标准正是计算工程预算的依据。也不可不考虑由于自然灾害等非人为的、不可抗力因素所造成的影响。认识与实践的变化，道路工程建设的过程，既是工程预算增减的过程，也是工程预算逐步接近实际的过程，如设计修改、施工图预算修正、对工程承包合同的修正等等。加强市政道路工程预算预算控制的措施在前期立项中的一个重要工作环节就是准确的编制投资估算，此部分是研究、分析建设项目的经济效果的重要依据。在编制投资估算时要注意建设标准和主要技术指标要采用合理，并对重大的技术措施方案要有充足的分析论证。在项目建设各阶段中，决策阶段决定工程预算的基础，项目决策的内容影响工程预算的程度 。